海洋生物生化與分子生物學：主要研究海洋動物、植物和微生物的生物化學和分子生物學，重點研究海洋生物的功能基因、蛋白質組學、病毒學、基因工程、生物能源開發和微生物生物技術等。
海洋生物遺傳育種學：主要研究海洋生物的遺傳多樣性與分子系統學，海洋經濟生物重要經濟性狀的功能基因組學，生物信息學，海洋生物數量遺傳學，分子育種學方法，海洋生物育種技術等。
海洋生物活性物質及其功能特性：運用化學和生物學相結合的方法，研究各種海洋生物活性物質的分離提取、鑒定及其利用，主要研究海洋藥物、海洋生物毒素、海洋防污活性物質、海洋植物生物活性物質等。
